Pour prouver l'innocence de son ancêtre et trouver la Cité perdue, Gates doit trouver un livre mystérieux et bien gardé contenant des siècles de secrets. Pour ce faire, Ben doit enlever le président.
Quand une page disparue du journal de John Wilkes Booth refait surface, l'ancêtre de Benjamin Franklin Gates est tout à coup impliqué dans la mort d'Abraham Lincoln. Déterminé à prouver son innocence et à trouver la Cité perdue, Ben doit trouver le dernier indice dans un livre mystérieux bien gardé qui contient des siècles de secrets. Mais pour y arriver, il doit enlever le président.