故事圍繞一個剛出生的寶寶展開。人字拖（成龍飾）雖有不凡的身手，可是終日沉迷賭博，毫無人生目標，便與包租公（許冠文飾）、百達通（古天樂飾）一起行竊，過著偷偷摸摸的犯罪生活。城中女富豪唯一的孫子出生後，包租公受不了金錢的誘惑，答應把寶寶偷給黑幫老大，以證明寶寶是否是他死去的兒子與前女友的孩子。 成功偷得寶寶後，一連串事情改變了人字拖及八達通的人生觀。人字拖開始關心家人，百達通也看到了老婆的辛勞，開始重新做人。 在包租公和黑勢力的威脅下，他們始終要交出偷來的寶寶，故事將會如何發展？各人又會否有大團圓結局呢？
寶貝計劃
「神偷拍檔」是由人字拖（成龍飾）、百達通（古天樂飾）和包租公（許冠文飾）所組成的怪盜集團，三人憑藉著高超的作案技巧和專業知識，再加上多年來累積的絕佳默契，可說是無堅不摧、合作無間。無論哪裡有錢賺，都逃不過他們手掌心。不過他們向來秉持著「盜亦有道」的精神，「不姦淫擄掠，也不傷天害理。」就是他們作案的最高宗旨。莫史迪探長（元彪飾）是人字拖的老同學，兩人一直維持著亦敵亦友的微妙關係，但也相安無事。
香港富豪李氏家族的掌上明珠敏兒（應采兒飾）為老公凱文（連凱飾）誕下兒子，卻惹來前男友洪建邦（尹子維飾）妒忌。洪建邦以為寶寶是自己的親生骨肉，不惜一切要搶奪嬰孩卻不慎失足摔死。其父洪峰（陳寶國飾）誤把寶寶當作是世上唯一的親人，竟出價三千萬元要「神偷拍檔」將寶寶綁走！
原本違反作案原則的「寶貝計劃」應該被推翻，卻因三人各自出現突發狀況而逼不得已被接下，人字拖和百達通在照顧寶寶的過程中也逐漸被寶寶的天真可愛感化。兩人在感情上也分別有所斬獲，人字拖邂逅了善良美麗的育嬰護士淑芬（高圓圓飾）；百達通的女友白燕（蔡卓妍飾）則忽然懷孕。約定「交貨」的期限即將到來，他們究竟會為了求財而交出寶寶，還是良心發現將寶寶送回李家團聚呢？