리플리의 마지막 모험으로부터 200년이 지나고, 군사 과학자들이 리플리를 복제해 흉부에서 에이리언 퀸을 꺼내고 리플리와 에일리언이 유전적 혼합체라는 사실을 이용한다. 한편 리플리는 첨단 기술이 적용된 여성형 인조인간이 포함된 밀수꾼들과 팀을 꾸려 지구로 돌진하는 실험실 우주선을 휘젓고 다니는 에이리언들과 전투를 벌이는데…
