マー二ーと弟たちは、離れて暮らす祖母(実は良い魔女)と共に旅に出る。行き先はハロウィーンタウン。不気味な生き物たちがごく普通に暮らしている町だ。
離れて暮らす祖母(デビー・レイノルズ)が実は良い魔女だと知ったマーニーと弟たちは、祖母の後を追ってハロウィーンタウンまでやってくる。ハロウィーンタウンは、魔女やゴブリン、吸血鬼などがごく普通に暮らしている町だ。マーニーは13歳の誕生日に自分が魔女の家系だと知る。邪悪な力がハロウィーンタウンを乗っ取ろうとしているのを知ったマーニーは、母や祖母を窮地から救うために立ち上がる。